A monitorização da qualidade ecológica das linhas de água a jusante das barragens do subsistema Ardila pretendeu estabelecer a situação de referência dos ecossistemas aquáticos a jusante destas barragens, para ajudar a definir o seu bom potencial ecológico e recolher elementos de base para a definição do regime de caudais de manutenção ecológica.
O trabalho envolveu cinco das oito barragens do subsistema e o estudo de sete componentes: topografia, qualidade da água, hidromorfologia, fitobentos, flora e vegetação, invertebrados bentónicos e ictiofauna. Seguindo as metodologias padronizadas da diretiva-quadro da água, incluiu levantamentos de campo, a realização de perfis topográficos, medições, a recolha de amostras para análise laboratorial e a amostragem das comunidades piscícolas recorrendo a pesca elétrica.
Este foi o primeiro de um conjunto de estudos efetuados pela Nemus para esta entidade em diversas linhas de água e blocos de rega ao longo dos anos seguintes.